Les pollutions diffuses touchent souvent des surfaces importantes et il est difficile d’apprécier la part transférée vers les rivières et les nappes. L’identification précise des sources de pollution et de leur part de responsabilité n’est donc pas aisée. Les pollutions diffuses s’opposent aux pollutions ponctuelles (type rejet d’eaux usées en rivière) que l’on peut localiser précisément.

Dans le Loir-et-Cher, les pollutions diffuses concernent essentiellement les nitrates et les produits phyto-sanitaires.